零基础分子动力学模拟上手指南
从安装配置到超算提交，覆盖 Windows、macOS 和 Linux 三大平台，帮助课题组同学跨过分子动力学模拟的第一道坎。
在线访问：www.whu-atmes.com/tutorial
| 章节 | 内容 |
|---|---|
| 为什么学 LAMMPS | 分子动力学简介、能源与动力领域典型应用 |
| Windows 安装 | 预编译安装包（下载即用） / WSL2 路线（完整 Linux 环境） |
| macOS 安装 | Homebrew 一键安装 / 源码编译 |
| 超算 / 集群 | Slurm 概念、sbatch 脚本模板、完整提交流程 |
| 第一份输入文件 | LJ 液体逐行注释，关键命令详解 |
| 本地与并行运行 | 串行 / MPI / Slurm 三种运行方式对比 |
| 案例 01 | LJ 液体热导率 — NEMD / Green-Kubo 方法 入门 |
| 案例 02 | SPC/E 液态水 — NPT 平衡、RDF、扩散系数 入门 |
| 案例 03 | 纳米通道水流动 — Poiseuille 流、滑移长度 进阶 |
| 案例 04 | 固-液界面热阻 — Kapitza 电阻、EAM 势 进阶 |
| 案例 05 | SAM-Au-水界面 NVT 平衡 — 真实科研案例 科研级 |
| 常见问题排查 | 6 类常见报错 + 解决方法（按安装/运行/超算分类） |
| 学习路线图 | 5 步进阶路线 |
| FAQ | 8 个常见问题，支持搜索 |
- 框架：React 19 + TypeScript + Vite 7
- 样式：Tailwind CSS 4 + oklch 色彩系统
- UI 组件：Radix UI (Accordion, Tabs, Tooltip 等)
- 字体：Noto Serif SC（标题） + Noto Sans SC（正文） + JetBrains Mono（代码）
- 部署：阿里云 OSS（香港） + Cloudflare CDN
- 包管理：pnpm
# 安装依赖
pnpm install
# 启动开发服务器
pnpm exec vite --host
# 构建（本地预览用，base path 为 /）
pnpm exec vite build详见 CLAUDE.md 中的完整部署文档。简要流程：
# 1. 构建（base path 设为 /tutorial/）
VITE_BASE_PATH=/tutorial/ pnpm exec vite build
# 2. 上传到 OSS
ossutil cp dist/public/ oss://whu-atmes-hk/tutorial/ --recursive --force
# 3. 修复 /tutorial 入口的 Content-Type
ossutil api put-object --bucket whu-atmes-hk --key tutorial \
--content-type "text/html; charset=utf-8" --body "file://dist/public/index.html"client/
src/
pages/Home.tsx ← 主页面（所有章节内容）
components/
Sidebar.tsx ← 左侧导航栏（深色主题、案例编号）
CodeBlock.tsx ← 终端风格代码块
AnnotatedCode.tsx ← 逐行注释代码块（悬停显示注释）
SectionHeading.tsx ← 章节标题（badge + 阅读时间）
StepIndicator.tsx ← 步骤指示器（编号 + 连接线）
InfoCard.tsx ← 信息卡片（优点/局限双栏）
WarningBox.tsx ← 提示/警告/注意框
ScrollReveal.tsx ← 滚动渐入动画
ReadingProgress.tsx ← 顶部阅读进度条
BackToTop.tsx ← 回到顶部按钮
index.css ← 全局样式、动画、自定义滚动条
index.html ← HTML 入口
vite.config.ts ← Vite 配置
CLAUDE.md ← 部署与运维文档
欢迎提交 Issue 或 Pull Request 来改进教程内容。如果你发现：
- 某个概念解释不够清楚
- 代码示例有错误
- 想增加新的案例
请直接在 Issues 中提出。
本站由 武汉大学 先进热管理及储能技术实验室（ATMES Lab） 维护，作者黄德钊。
LAMMPS 是 Sandia National Laboratories 的开源项目，本站内容仅供学习参考。