fix(worker): PR3 调度/抓取链路 High 修复 6 项（session隔离+cs_feed关联+auto_link池+download_pdf异步+调度配置+graceful）

[Color2333]

背景

Worker 抓取逻辑审计的 6 个 High 调度/抓取链路问题。基于 PR1（#46）+ PR2（#49，均已合入 main）之上。本 PR 重建（原 #48 因 PR2 合并删 base 分支自动关闭）。完成本 PR 即 3 PR 全部就绪。

修复清单

3a cs_feed 每 sub 独立 session（High）

packages/ai/cs_feed_orchestrator.py run() 此前单 session 跨所有 sub，一个 sub 抓取异常后的脏数据污染下个 sub。改：先读订阅列表后关闭读 session，每 sub 开独立 SessionLocal，upsert_paper + update_run_status 在 sub session 内 commit。冷却设置也走独立 session。

3b cs_feed 抓取论文触发 embed + skim（High）

此前 cs_feed 只 upsert_paper 无 embed/skim，论文处于 unread 无 embedding 只能靠 idle_processor 事后补。新增 _process_cs_papers，抓取即复用 PaperPipelines 触发 embed + skim（限流 + 并发控制），失败不抛不阻断抓取主流程。

3c _bg_auto_link 线程池化（High）

packages/ai/pipelines/paper_pipelines.py 此前 threading.Thread(...).start() 无界 daemon 线程，5 个 topic 各起线程可能失控。改用模块级 ThreadPoolExecutor(max_workers=2) 复用，submit 替代 start。两处 collect（arxiv/IEEE）都改用池。

3d download_pdf 异步化 + 失败可见（High）

packages/ai/tools/handlers/ingest.py 逐篇同步 download_pdf 90s 超时阻塞 + 失败静默。改后台线程池下载（不阻塞 ingest 主流程），失败记录到论文 metadata（pdf_download_failed），deep_dive 时可见。新增 _download_pdf_async + _pdf_download_pool（max_workers=2，独立 session 隔离）。

3e worker 调度配置（High）

apps/worker/main.py 整点双 cron + 默认单线程池 + misfire_grace_time=1。给 4 个 job 显式配 max_instances=1, misfire_grace_time=300, coalesce=True。topic_dispatch 与 cs_feed_dispatch 错开分钟（topic minute=0，cs_feed minute=5）。executor 配 apscheduler ThreadPoolExecutor(max_workers=3)。

3f graceful shutdown 等待任务（Med）

shutdown(wait=False) 改 shutdown(wait=True)，让 _process_paper 跑完，避免已下载 PDF 未 set_pdf_path 的中间态丢失。

验证

• ruff / format 全通过
• pytest：55 passed, 2 skipped（无回归）
• alembic upgrade head 迁移链完整（PR3 无新迁移，链到 PR2 的 head f6a7b8c9d0e1）
• scheduler 配置实例化验证：max_instances=1, misfire_grace_time=300, coalesce=True 生效；topic minute=0 / cs_feed minute=5 错开
• 运行时：cs_feed _process_cs_papers 空列表安全返回；线程池 max_workers 正确；worker main 导入正常

部署影响

• 无新迁移、无新增配置项
• 调度时间微调：cs_feed 从整点改为 :05（错开 topic_dispatch）
• graceful shutdown 改 wait=True，关闭时间略增

[github-actions]

🔍 OpenCode PR Review Required

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/oc review https://github.com/Color2333/PaperMind/pull/$PR_NUM

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